成为帝国皇帝，授予朱雀“零之骑士”的称号，加上效忠于他的杰雷米亚等人，一行人开始在帝国内部大肆破坏。
他们所做的一切似乎并不是坏事，但不认可他们的人还很多，包括曾经由鲁路修一手创建起来的黑色骑士团和超合众国的人。
一番谋划，鲁路修成功抓住超合众国的重要成员，只是，还没等他利用人质让超合众国臣服于他，曾经的帝国二皇子修奈杰尔露面，一发芙蕾雅，将帝国的都城夷为平地。
紧接着，最大的反转出现：娜娜莉居然没有死。
娜娜莉从修奈杰尔口中得知了鲁路修zero的身份，公开表态，要站在修奈杰尔那边，正式走上鲁路修的对立面。
鲁路修十分动摇，但为了他和朱雀口中的“零之镇魂曲”，还是坚持与娜娜莉为敌。
随后，鲁路修率领帝国军团，与修奈杰尔和黑色骑士团的联军，展开一场大决战。
战况十分激烈，双方打得难解难分。
不过，就在外面打得不可开交的时候，鲁路修成功潜入修奈杰尔等人所在的基地，凭借对修奈杰尔的了解，骗过修奈杰尔，利用王之力对其下达了“侍奉zero”这样的命令。
第二十四话的末尾，鲁路修找到手握“芙蕾雅”控制器并且被修奈杰尔欺骗了的娜娜莉。
让他惊讶的是，娜娜莉居然凭借自己的意志冲破了身上Geass的力量，双眼恢复，能看见了。
这一话的最后，娜娜莉目不斜视，朝鲁路修发问：“哥哥，也会对我使用Geass吗？”
……
就故事节奏而言，最后几话算是有点偏快了，加上信息量太过庞大，以至于给人一种超展开的感觉。
话虽如此，内容整体上还算精彩。
各种反转一个接一个地甩出来，也引发了大量观众的讨论。
只是，眼看着只剩下最后一话了，观众们都有点懵：结局怎么搞？
动画的名字叫《反叛的鲁路修》，照常理来说，鲁路修反叛布里塔尼亚帝国，成功或者失败，就该完结了，但是，鲁路修掌控布里塔尼亚帝国，靠的并不是他之前的努力，而是干掉原来的皇帝，直接加冕称帝，利用Geass来让帝国内部的那些人臣服于他。
现在要对付的已经不是帝国，而是他曾经一手创建的黑色骑士团以及不认可他的原帝国二皇子修奈杰尔。
已经不再是反叛，甚至说是镇压反叛还差不多。
动画到第二十四话，一场大决战，虽然还没分出胜负，但修奈杰尔已经被Geass的力量控制住。
娜娜莉倒是还握有芙蕾雅的控制器，但她又没有Geass，加上行动不便，不可能会是鲁路修的对手。
也就是说，鲁路修已经胜券在握，接下来完全可以直接将芙蕾雅的控制器夺过来，命令黑色骑士团和修奈杰尔的那些部下投降。
可是，鲁路修获胜就完了吗？
反叛，反叛成功，镇压所有不服的声音，统治全世界，建立新秩序，然后全剧终？
作为爽番，好像这样的结局是理所当然的，但是，这样的结局未免太俗套了点。
而且，说《鲁路修》是爽番也不太对，两季的前半段确实都很爽，但后半段可是一点都不爽，甚至“《鲁路修》是世纪爽番”都变成一个梗，成为众多粉丝对这部动画的一个调侃。
既然中后期都不爽了，采用这种爽番式的结局，也有点说不过去。
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